وفي ما يلي خلاصة الأسس التي جرى عليها في عمل هذا المعجم ولاسيما في الإخراجة الرابعة للمعجم الطبي الموحد وما تفرع عنه
1-استعملت لفظة عربية واحدة مقابل التعبير الأجنبي، ولم تستعمل المترادفات إلا في ما ندر وعند الضرورة القصوى، فبذلك يتحقق توحيد المصطلحات
2-إذا وجدت عدة مترادفات أجنبية للمفهوم الواحد لأسباب تاريخية، عمد إلى ترجمة أصلحها لتأدية المعنى
3-استعملت الألفاظ العربية المتداولة أو التي سبق أن استعملها علماء العرب الأقدمون، إذا كانت تفي بالغرض العلمي، وإلا اجتهد في وضع لفظ جديد مناسب
4-تم استعمال الكلمات الدخيلة "الأعجمية المعربة" حين اللزوم، ولاسيما حين يتعذر على المعجمين العثور على لفظة عربية تقابل اللفظة الأجنبية، أو يتعذر إيجاد لفظة عربية تفيد معناها بوسائل الاشتقاق المعروفة، أو حين تكون الكلمة العربية المقترحة أشد عجمة من الكلمة الدخيلة، أو يكون اللفظ مما اشتهر وشاع استعماله، أو يكون من الألفاظ التي اكتسبت صفة العالمية بدخوله كما هو في كل لغات العالم أو جلها
5-حرص في استعراب الكلمة على أن توضع في صيغة يسهل جمعها والنسبة إليها والاشتقاق منها
6-اعتبر المصطلح المعرب عربياً يخضع لقواعد اللغة العربية
7-التزم في هذه الكلمات الدخيلة أو المستعربة أن اختيار اللفظ الأسهل من بين مختلف اللغات الأجنبية، ولا سيما اللاتينية والإنكليزية والفرنسية، لنقله إلى العربية بأخف ما يمكن على اللسان العربي، دون الالتزام لغة أجنبية واحدة
8-على الرغم من أن المعجم قد ضبط بالشكل (التشكيل) ضبطاً يبعد اللبس، فقد أخذنا في الاعتبار صعوبة توافر الشكل في المطابع والمناسخ، فأكثر من استعمال الأحرف اللينة في الكلمات المعربة حتى لا يلتبس اللفظ
9-ترجم أسماء الأجناس والأنواع في تصانيف الأحياء من حيوان ونبات وجراثيم ولم يتم استعرابها